藤幡正樹是全球新媒體藝術的先驅之一，從20世紀80年代初開始從事視頻和數碼成像工作。他是最早使用立體光刻技術的藝術家之一，這種技術使用激光掃過液體樹脂的表面使其聚合。

他憑電腦圖像作品在20世紀80年代闖出名堂，之後他開始對使用數據以三維打印技術製作三維雕塑產生興趣，如數控路由作品《Geometric Love》（1987）、立體光刻作品《Forbidden Fruits》（1989），以及使用集成電路製造技術製造出世界上最小型的雕塑。 到了1990年代中期，藤幡正樹製作了後來被稱為「互動藝術」的一些經典作品，包括使用了紅外無線電話的《Removable Reality》（1992）；《Impression Velocity》（1994），藝術家使用配備GPS的筆記本電腦以數碼測圖富士山；探索網絡技術的《Beyond Pages》（1995-1997）和《Global Interior Project》（1995）。他的作品對人們在不同介面的互動以及在虛擬空間的溝通提出質疑。

近年他主要的關注點，是採用多媒體技術探討在虛擬空間內溝通的可能性，尤其在1992年開始的GPS技術實驗，以不尋常的技術收集數據，從而製作一系列精心製作和無可比擬的網絡空間創作，這些創作可稱作「未來的電影」或「將來的媒體」。他的《Field-work @ Alsace》（2003）彙編有關國際邊界的訪談。音樂作品《Simultaneous Echoes》（2009）在北愛爾蘭創作，而《活力之聲》（2012）則在法國南特創作，匯集在虛擬空間呼叫的騎單車者的聲音。